使用这 4 个 Cladogram Maker 生成公共树

还在为绘制进化分支图发愁吗?

是否还在苦恼于如何从头开始设计一个进化分支图?别担心,这里有一些强大的工具可以帮助你轻松创建分支图。

我们从小在生物课上就学到,生物之间存在着各种联系,例如猿类被认为是人类的祖先,以及生物之间在食物链中的关系等等。

进化分支图,也称为系统发育树,展示了生物之间基于DNA序列、形态特征以及表型上的祖先关系。 它就像一棵进化树,让我们能够根据生物相似的特征、进化历程和适应性对它们进行分类。 通过比较和绘制分支图,我们可以推断出最合理的进化假设。

分支图使用线条来表示进化枝与其他祖先或生物群体的进化方向。 我们可以沿着这些线条追溯到代表假设祖先的起始和结束位置。

在必要时,我们还可以利用行为数据(针对动物)在分子和形态水平上对生物进行划分。 分支图生成算法通过输入数据来执行优化任务。 其目标是找到全局最小值,通常采用模拟退火方法来确保提出最佳解决方案。

下面是一些你可以选择的分支图绘制工具:

Creately

使用 Creately 的分支图生成器,你可以轻松可视化物种之间的联系。 Creately 可以有效地识别和可视化系统发育关系,是一个展示各种生物物种之间关系的绝佳工具,具有以下特点:

  • 支持导出为PDF、SVG和PNG格式,便于打印和分享。
  • 提供多种系统发育和分支图模板。
  • 可以在画布上轻松可视化关系。

Creately提供了丰富的形状库,包括二分键、食物网、系统发育树以及用于生物分组的多种模板。 通过简单的拖放操作、高级文本格式以及可配置的颜色主题,你可以轻松创建关系图。

Creately还提供了拖放动物图像和动态连接器的功能,可以无缝扩展、旋转和调整图表大小。你可以利用内置的Google图像创建动态分支图,并整合无限画布、全文搜索、内置工具以及多功能表格中的研究数据。

实时光标、用于讨论的评论区以及视频会议功能方便了与他人的协作。

Insight Maker

Insight Maker 是一个在网络浏览器中构建模型的简化工具。 你可以轻松创建随意的流程图和信息丰富的图片。使用Insight Maker,你可以模拟各种情景,例如人口互动和定义代理行为。

Insight Maker 的优点:

  • 在网页浏览器上即可启动,无需插件或下载。
  • 将你的想法放在画布上,创建仿真模型、信息丰富的图片和各种见解。
  • 使用仿真算法,从基于代理和系统动态建模开始。
  • 与团队合作,收集他们对设计的反馈意见。
  • 免费创建模型,发挥你的创造力。

最重要的是,用户可以浏览其他人的分支图,并查看他们在做什么。 这有助于集思广益,提出最佳解决方案。

Guilford

使用SimpleClade与Guilford,你可以进行理想的分支分析。 它提供了一个图形用户界面,让古生物学研究中的工作流程更加简洁。 此外,该工具易于使用,安装后即可立即开始工作。

用户可以创建自己的CSV数据文件并开始生成进化枝。 该工具包含了细胞的整个过程,用户可以快速学习微分值。 用户可以将未使用的进化枝标记为“未使用”,并输入其他进化枝的值。

用户可以通过选择解释其查询的节点、根据需要更改连接、计算简约统计、连接外群的水平根茎,以及查看特征状态变化等操作来进行程序操作。

IUBio

IUBio 是另一个流行的工具,可以用来绘制分支图、欧洲图、俯冲图、曲线图、表形图和树状图。 它易于使用,你只需上传树文件(或粘贴URL),输入标题,然后提交详细信息即可。

IUBio还允许用户选择其他选项以获得所需的输出,例如标签的基本URL、样式、字体、大小等等。 它还允许用户选择树的生长和节点位置,以使其看起来更美观。

这个在线工具处理多种事物,例如节肢动物、DroSpeGe、enGenes、wFleaBase等等。 它为生物信息学和分子生物学领域的用户提供了公共访问。 IUBio 包括果蝇基因组、序列分析、生物序列转换以及任何用途的编辑器。

总结

分支图绘制工具允许通过分支和核苷酸替换的遗传变化数量来表示进化谱系。 也可以根据序列中的百分比变化来表示变电站。

此外,在关注分支和节点(内部和外部节点——叶子和尖端)时,需要维护树结构。 分支图还包括用来提出最终共同祖先的分子时钟。

开始使用分支图标记,获得你想要的结果吧!